好在朱由校并不是把九边的事情，一股脑地推给熊廷弼就完事，在任命熊廷弼为九边提督的同时，朱由校还同时任命在泰昌元年八月两度击败努尔哈赤，攻克灰山、抚安堡的贺世贤为辽东总兵，总理辽东兵事，同时任命靖东营游击祖大寿为副总兵，辽东镇练兵游击毛文龙为辽东水师总兵！
并且在圣旨中明确命令贺世贤要坚决按照熊廷弼的既有政策，筑堡迁民，强兵制器，随时准备应对后金的进攻！
又命令毛文龙率领辽东水师将皮岛作为前进基地，骚扰后金的后方，同时占据朝鲜国的济州岛作为辽东水师的保障基地。
朱由校对毛文龙的要求就是，以最小的代价，袭扰后金，使其不得安宁，同时要机动灵活地配合主力，完成对后金兵力的牵制！
如果按照原来的历史轨迹，贺世贤会在天启元年，在后金进攻沈阳时力战而死，但那是在熊廷弼被罢官之后才出现的情况，如今熊廷弼不但没有罢官，还被朱由校提升为九边提督，贺世贤的命运如何就要再看看了。
不过贺世贤作为辽东镇的老将，一辈子能熬到这个位置，还不用受中官和文官的辖制，已经是感到心满意足了，同时他对熊廷弼也佩服的很，因此对于朱由校的旨意，执行的也极为坚决！
祖大寿和毛文龙这两位后世颇为有名气的将领，现如今还只能算是崭露头角的后起之秀，对于朱由校这种超拔自然更是感激不尽，同时他们根基尚浅，心里也有抱熊廷弼大腿的打算，故此对于熊廷弼可以说是言听计从，这让熊廷弼人虽然在大同，但对辽东一线的战事，依然可以做到如臂使指！
另外朱由校还将熊廷弼手下的一员大将曹文诏直接提拔成大同总兵，这让熊廷弼感到更加的贴心，因为曹文诏在熊廷弼手下表现出了极其优秀的军事才能，而且曹文诏不过三十多岁，这次提拔成总兵也是超拔，自然是对曾经上表表扬过他的熊廷弼感激不尽，熊廷弼用起来也是得心应手！
不过也不是所有的事情都让熊廷弼感到满意，首先九边的监军中官全部撤走了，这虽然松开了熊廷弼的手脚，可也让他感到压力倍增，其次是从京城传来的公文看，当今那位小皇帝似乎开始重新任用武勋了！
英国公张维贤竟然就任兵部尚书，听说为了这事儿京里还有人叩阙，只不过这次叩阙发生的突然，结束的也潦草，最后竟然没人反对这件事了！
张维贤不但坐稳了兵部尚书的位置，就连整个兵部也从六部中剥离出来，而他这个兵部左侍郎虽然看起来还是文官，可实际上却已经进入了武官的行列，因为在已经明确的隶属关系上，他直接对应的是兵部，而不是内阁！
也就是说熊廷弼现在有任何事情，都要上报兵部，接到的命令也是从兵部下发的，至于以内阁为首的文官系统，就跟他没有任何关系了，对此骨子里始终认为自己是文人的熊廷弼，还是有些芥蒂的，毕竟文贵武贱的思想早已经刻深深在了他的心里！
所以以熊廷弼的本意来说，他是不愿意弃文从武的，可是以熊廷弼目前的处境来看，他又必须接受这个现实，因为他在蓟辽总督的任上可是得罪了不少人，也遭到不少人的弹劾，这说明在文官之中已经有人要收拾他了！
同时熊廷弼也从一些渠道听说，叩阙的事情之所以潦草收场，跟对他的弹劾有些关系，那些弹劾他的人也都被收押待参了，这几件事加在一起，已经让他熊廷弼很难在文官中混了。