正当柯南混的风生水起的时候，灰原哀的APTX4869有了巨大突破，在猴子身上的实验成功率高达90%。
90%这个成功率已经可以进行人体实验了，而第一只“小白鼠”自然就是迫不及待的柯南同学了。
灰原哀和增山雪根据柯南的基因制作APTX4869的解药，柯南服用解药之后变回了工藤新一。
工藤新一无比兴奋的去找小兰分享这个好消息，现在他已经不用瞒着小兰了，可以把一切都告诉她了。
然而，得知了一切真相的小兰并没有显得多开心，反而一拳轰碎了电线杆。
这天，工藤新一的惨叫声直冲云霄，绕梁三日，不绝于耳。
柯南变回工藤新一后，灰原哀犹豫了一下，没有选择吃下解药，她过去的人生太压抑了，现在好不容易有了重新开始的机会，她和姐姐也从组织的视角里消失了，那就让宫野志保这个人彻底死去吧！以后她只会是灰原哀了。
而另一边，华夏的一个小县城里，一座自建的小别墅完工了，花园里里有两只毛色雪白的猫撒着欢，楼门口一男一女靠在躺椅上看着两只小猫。
“远，你为什么要辞职来这里定居呢？想躲避组织的人追杀，应该有更好的选择才对吧？”越水七槻用半生不熟的华夏语问道。
“因为很久很久以前，我在梦里就梦到过这个城市，在梦里这里就是的家乡，我一开始以为这只是一个梦，没想到这个地方居然真的存在。”
“梦里的家乡？难怪你对这里这么熟悉，这也太神奇了吧？”
增山远笑了笑没有说话。
这座城市何止是他梦里的家乡，前世他可是在这里生活了二十多年的。
除了他去上大学的那个城市以外，这里就是他最熟悉的地方了。
而眼前这栋小别墅，也是根据增山远前世的记忆里的样子修建的，说是别墅其实更像是农家自建的小二楼。
看着眼前的这一切，增山远有种不真实的感觉，仿佛他没有穿越过，也没有经历这么多的事情，但身边躺着的少女却告诉他，这一切都是真实的。
“远，你以后都不打算回岛国了吗？”越水七槻问道。
“当然不是了，我可不是那种不负责任的人，等过段时间我会回去解决组织的事情。”
“过段时间？要过多久？”越水七槻问道。
“不会太久的，现在有公安和fbi在围剿组织，让他们先替我们打打头阵。”
......
随着柯南变回了工藤新一，柯学世界的时间重新开始流动了起来。
这天早上，少年侦探团和灰原哀一起从毛利侦探事务所前路过。
“远哥哥的店关门这么久了，还会不会开啊！”光彦看着增山远的店感叹道。
“谁知道呢！那家伙说出去度假了，没想到走了这么久都没有回来。”灰原哀没好气的说道。
“光彦，增山先生以后肯定会回来的，比起增山先生来，我更想柯南，他和父母一起离开了岛国，转学去了国外，这么长时间了他都没有给我们写过信，不知道他过得好不好。”步美语气哀伤的说道。
“步美，我们现在已经是二年级了，等我们升到高中的时候，柯南要是还没有回来的话，我们修学旅行的时候就去他在的城市找他好了。”元太说道。
“那还要好多年啊！”
“过去这么多年柯南说不定就先回来了呢！”光彦跟着说道。
步美闻言觉得很有道理，脸上重新露出了笑容。
四个孩子走后，工藤新一和小兰才从一边出来。
“都怪你，步美要伤心很久了。”小兰对工藤新一说道。
“我也没办法啊！也不是我想变小的。”
“总之这件事就是你的责任。”
“谁说的？这件事不应该是组织的责任吗？就算不是组织，也应该是药物研发者灰原的责任吧？”
“谁让你好奇心那么重，你当时要是不追出去的话，就不会被喂下那种药物了。”
两人一边吵着一边走向了学校，对工藤新一来说，柯南只是他人生的一段经历，他从始至终都是工藤新一。
不知不觉一年过去了，刚刚高考结束的小兰拉着工藤新一帮忙打扫着增山远的店里。
“兰，为什么要我打扫这家店？”工藤新一抱怨道。
“因为我之前答应增山先生了啊！”
“那是你答应的啊！又不是我。”
“你的意思是，我帮忙打扫，你就在一边站着看着？”小兰没好气问道。
工藤新一脖子一缩不敢说话了。
就这样两人卖力打扫了一下午，打扫干净后，工藤新一瘫坐在地上说道：“累死了，增山先生也太会使唤人了，下次见到他我一定要让他......”
“让我怎么样？”
一个熟悉的声音从门口传来，小兰和工藤新一不约而同的朝门外看去。
两天后，歇业一年多的猫咖重新开业了，和以前一样这间店的老板经常不在，不知道在忙些什么。