这时，何应钦在外打猎未归，不知道发生了什么事情。蒋介石从徐州电召何应钦的大舅子交通部长王伯群、中央执委书记李仲公及何成浚、贺耀祖、陈调元等赴徐州开会，惟独不召何应钦前去。蒋介石向李、王二人讲明他撤销何应钦职务的原因：
一是他曾与白崇禧联合逼他下野。
二是他迟迟不发拥戴电支持蒋介石复职。
三是桂系在外散布蒋介石已经指挥不了黄埔军的言论。
"所以，我来前方试试看，我究竟能不能掌握黄埔军。"蒋介石的用意是要通过李、王二人向何应钦提出警告，不许在嫡系中有离经叛道的行为。同时蒋介石宣布，调何应钦任总司令部的参谋长。这样的处置，蒋介石既削了何应钦的实权，也留有了余地。
撤销何应钦的职务后，接着，蒋介石又以军纪弛废为名，将第一路军整编为第一集团军，自兼集团军总司令，下辖三个纵队，分别以刘峙、陈调元、贺耀祖为三路纵队总指挥。
但这时蒋介石还不能完全踢开何应钦，在狠打之余又予以轻拉，安抚他要小心审慎，不要受各派系的挑拨，声称"待我将部队整理就绪，仍然请你回来统率"。何应钦深怀惊惧，羞愤难当，于是告假两个月，避居上海，蒋介石又亲往上海抚慰，然后，何应钦才到总司令部就任参谋长之职。
何应钦从此失宠，蒋介石也没有履行请他"回来统率第一军"的诺言。打下北京之后，只给他以"国军编遣筹备委员会主任委员"、"训练总监部总监"之类无实权的职务。
蒋介石杀鸡儆猴的办法，给反对过他的人敲了警钟。
【点评】杀鸡儆猴即杀一儆百，其作用巨大。
在发现下属的不轨行为时，惩罚为首，可以警戒从犯；在对付对手的厮拼中，摧毁对方的核心力量，可以震慑其余弱小对手。杀鸡儆猴可以达到奇效。
这种手段极其阴险，但在短时期内却能收到立竿见影的效果。蒋介石第二次上台以后，当务之急是巩固他的统治地位。这时，南京政府面临着错综复杂的矛盾。但是，对蒋介石来说，最根本的问题是设法把国民党各派势力纠合起来，听从他的指挥。为了驾驭派系林立的国民党新军阀，整顿国民党内部，蒋介石可谓煞费苦心，他先从整治自己的嫡系部队开刀。他剥夺何应钦的兵权，即可警戒其他不从者，从而震慑别有企图者。这是他树立个人权威，巩固地位的厉害一着，也是高明的处人之术。