1979年5月29日—7月17日，圣地尼斯塔游击队继续发动进攻，在一个星期内便占领了大多数城市和大片的乡村并包围了马那瓜 游击队已稳操胜券。他们组织了一个五人临时执政团(7月17日)。美国曾建议他们与较温和的反对派组成联合政府，但为时已晚。在美国的坚持下，索摩查离开了马那瓜，逃往美国的迈阿密。
1979年7月19日，圣地尼斯塔游击队取得了最后的胜利，进入马那瓜游击队开进首都马那瓜 之后便建立了自己的新政权。
1979—1981年，圣地尼斯塔巩固政权 起初，政府鼓励新闻自由和自由经济，但到1980年底，政府的政策发生了180°左转。他们开始严格审查各种出版物并将大选推迟到1985年。他们强行将米斯墓托的印第安人驱赶到偏僻的东北部并开始排斥美国，逐渐向古巴和苏联靠拢。到1981年底，尼加拉瓜约有5000多名古巴、苏联和巴勒斯坦解放组织的军事和技术顾问。
1981—1990年，内战 在里根政府的支持下，尼加拉瓜流亡分子开始在洪都拉斯和哥斯达黎加组建游击队并以这两个国家为基地，开展反政府运动(1981—1982年)。他们自称是抵抗组织。原国民警卫队的成员主要以洪都拉斯为基地(实际上尼加拉瓜人并不欢迎他们)，其兵力已达到25000人，其中有2500人常年在尼加拉瓜活动(1985—1986年)。这些抵抗组织为了在尼加拉瓜得到较多民众的支持，不轻易地攻击现政权。但在美国经济和外交的压力下，他们最终还是推翻了圣地尼斯塔的统治(1990年)。
1984年4月4—14日，中央情报局“秘密“在科林托港口布雷被揭露 中央情报局的这一行动严重违反了国际法。当这一行径被披露后(4月6—10日)，在美国公众中间引起了极大的反应，他们对美国政府的中美洲政策提出了强烈的批评。美国国会也谴责了这一行径(4月11日)。
1984年9月1日，两名美国人在尼加拉瓜被杀 两名自发的反政府游击队顾问所乘的一架直升机被击落，两人当即身亡。他们是与中央情报局有关系的、自称为民间军事援助组织(是一个非官方组织)的成员。
1984年10月14—21日，美国新闻界披露了中央情报局的一份《游击战战术手册》，引起了一场轩然大波 该手册介绍了如何争取敌政府(这里显然是指圣地尼斯塔政府)的官员保持“中立“，等等。一名反政府游击队的成员也承认，此前他们曾暗杀过圣地尼斯塔政府的官员。
1984年11月6—12日，苏联提供武器，造成危机 美国宣称，苏联正在向尼加拉瓜运送大批的武器装备，其中包括米格—21战斗机，美国对此是不能容忍的。但在卸船时，观察员并未发现有战斗机(11月7--10日)。圣地尼斯塔政府担心美国会发动人侵，因此宣布全国进入战时状态(11月12—13日)。