尽管董仲舒和李斯在前期都相当高调，而后来又识时务地顺应潮流，但是董仲舒比李斯确实要聪明，不仅仅是手段高明。按照中国人“恻隐之心“大多倾向于同情弱者，所以近年来为李斯翻案的都叫好，而为董仲舒翻案的都被骂得狗血淋头。
说董仲舒聪明，是因为他在培养人才上比李斯做得到位。李斯当时也提出“有愿习法令者，以吏为师“，但这对于纵深横远地让法家思想扎根于民众显然是不够的。董仲舒就不一样了。我们来看历史。建元五年，武帝设置儒学五经博士，同时罢免其他诸子博士，把儒学以外的百家之学排斥出官学，史称“抑黜百家，表彰六经“。元朔五年，武帝下诏批董仲舒、公孙弘建议，在长安兴办太学，用儒家经书教育青年子弟，从此儒学成为官办学校的主体内容。武帝改造选官制度，规定博士弟子成绩优异者可任为郎官，吏有通一艺者可选拔担任重要职务，还打破常规起用布衣儒生公孙弘为丞相。这样随着儒学地位的上升，封建政治与儒学密切结合起来，当我们一谈古代思想，那就是封建思想，而封建思想就是儒家思想，不管是孔子的儒，还是董仲舒的儒，总之，儒家思想就成了封建思想的实质内核。可是，法家思想却没有在李斯的主张下提升到更高的层次。
此外，还有一系列为确保儒家独尊而采取的措施。
一、设五经博士
战国时就有博士，秦汉承袭此制，也设立博士官。博士是掌管典籍簿册的咨政议政官员，诸子、术数、方技等都立博士。汉武帝建元五年“置五经博士。“此后，博士的职位就只有被官方认可的儒家五经大师才能担任，其他学派虽然没有像秦代那样被明令取缔，但已不能取得官方学术的地位了。这一措施是“独尊儒术“的集中体现。